Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms