Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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GTF3C6Q969F1 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF3C6Q969F1 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
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GTF3C6Q969F1 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF3C6Q969F1 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF3C6Q969F1 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF3C6Q969F1 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF3C6Q969F1 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF3C6Q969F1 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF3C6Q969F1 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF3C6Q969F1 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF3C6Q969F1 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
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