Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms