Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
BHMTQ93088 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BHMTQ93088 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BHMTQ93088 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BHMTQ93088 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BHMTQ93088 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BHMTQ93088 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BHMTQ93088 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BHMTQ93088 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BHMTQ93088 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BHMTQ93088 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BHMTQ93088 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
BHMTQ93088 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
BHMTQ93088 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BHMTQ93088 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BHMTQ93088 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BHMTQ93088 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BHMTQ93088 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BHMTQ93088 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BHMTQ93088 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BHMTQ93088 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BHMTQ93088 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BHMTQ93088 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BHMTQ93088 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BHMTQ93088 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BHMTQ93088 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BHMTQ93088 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BHMTQ93088 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BHMTQ93088 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BHMTQ93088 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BHMTQ93088 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BHMTQ93088 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BHMTQ93088 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BHMTQ93088 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BHMTQ93088 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms