Protein–RNA interactions for Protein: Q92664

GTF3A, Transcription factor IIIA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3AQ92664 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms