Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CTTNBP2Q8WZ74 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CTTNBP2Q8WZ74 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CTTNBP2Q8WZ74 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CTTNBP2Q8WZ74 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CTTNBP2Q8WZ74 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CTTNBP2Q8WZ74 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CTTNBP2Q8WZ74 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CTTNBP2Q8WZ74 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CTTNBP2Q8WZ74 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CTTNBP2Q8WZ74 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CTTNBP2Q8WZ74 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CTTNBP2Q8WZ74 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CTTNBP2Q8WZ74 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CTTNBP2Q8WZ74 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CTTNBP2Q8WZ74 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CTTNBP2Q8WZ74 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CTTNBP2Q8WZ74 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CTTNBP2Q8WZ74 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CTTNBP2Q8WZ74 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CTTNBP2Q8WZ74 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CTTNBP2Q8WZ74 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CTTNBP2Q8WZ74 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CTTNBP2Q8WZ74 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CTTNBP2Q8WZ74 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CTTNBP2Q8WZ74 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CTTNBP2Q8WZ74 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CTTNBP2Q8WZ74 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CTTNBP2Q8WZ74 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CTTNBP2Q8WZ74 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CTTNBP2Q8WZ74 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CTTNBP2Q8WZ74 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CTTNBP2Q8WZ74 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CTTNBP2Q8WZ74 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CTTNBP2Q8WZ74 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CTTNBP2Q8WZ74 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CTTNBP2Q8WZ74 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CTTNBP2Q8WZ74 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CTTNBP2Q8WZ74 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CTTNBP2Q8WZ74 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CTTNBP2Q8WZ74 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CTTNBP2Q8WZ74 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CTTNBP2Q8WZ74 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CTTNBP2Q8WZ74 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CTTNBP2Q8WZ74 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CTTNBP2Q8WZ74 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CTTNBP2Q8WZ74 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CTTNBP2Q8WZ74 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CTTNBP2Q8WZ74 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CTTNBP2Q8WZ74 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CTTNBP2Q8WZ74 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CTTNBP2Q8WZ74 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CTTNBP2Q8WZ74 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CTTNBP2Q8WZ74 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CTTNBP2Q8WZ74 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CTTNBP2Q8WZ74 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CTTNBP2Q8WZ74 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CTTNBP2Q8WZ74 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CTTNBP2Q8WZ74 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CTTNBP2Q8WZ74 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CTTNBP2Q8WZ74 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CTTNBP2Q8WZ74 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CTTNBP2Q8WZ74 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CTTNBP2Q8WZ74 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CTTNBP2Q8WZ74 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CTTNBP2Q8WZ74 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CTTNBP2Q8WZ74 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CTTNBP2Q8WZ74 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CTTNBP2Q8WZ74 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CTTNBP2Q8WZ74 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CTTNBP2Q8WZ74 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CTTNBP2Q8WZ74 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CTTNBP2Q8WZ74 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CTTNBP2Q8WZ74 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CTTNBP2Q8WZ74 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CTTNBP2Q8WZ74 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CTTNBP2Q8WZ74 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CTTNBP2Q8WZ74 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CTTNBP2Q8WZ74 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CTTNBP2Q8WZ74 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CTTNBP2Q8WZ74 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CTTNBP2Q8WZ74 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CTTNBP2Q8WZ74 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CTTNBP2Q8WZ74 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CTTNBP2Q8WZ74 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CTTNBP2Q8WZ74 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CTTNBP2Q8WZ74 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CTTNBP2Q8WZ74 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CTTNBP2Q8WZ74 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CTTNBP2Q8WZ74 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CTTNBP2Q8WZ74 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CTTNBP2Q8WZ74 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CTTNBP2Q8WZ74 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CTTNBP2Q8WZ74 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CTTNBP2Q8WZ74 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms