Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCG3Q8WXD2 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCG3Q8WXD2 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCG3Q8WXD2 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCG3Q8WXD2 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCG3Q8WXD2 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCG3Q8WXD2 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCG3Q8WXD2 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCG3Q8WXD2 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCG3Q8WXD2 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCG3Q8WXD2 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCG3Q8WXD2 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCG3Q8WXD2 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCG3Q8WXD2 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCG3Q8WXD2 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCG3Q8WXD2 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCG3Q8WXD2 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCG3Q8WXD2 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCG3Q8WXD2 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCG3Q8WXD2 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCG3Q8WXD2 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCG3Q8WXD2 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCG3Q8WXD2 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCG3Q8WXD2 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCG3Q8WXD2 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCG3Q8WXD2 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCG3Q8WXD2 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCG3Q8WXD2 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCG3Q8WXD2 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCG3Q8WXD2 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCG3Q8WXD2 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCG3Q8WXD2 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCG3Q8WXD2 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCG3Q8WXD2 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCG3Q8WXD2 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SCG3Q8WXD2 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCG3Q8WXD2 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCG3Q8WXD2 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCG3Q8WXD2 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCG3Q8WXD2 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCG3Q8WXD2 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCG3Q8WXD2 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCG3Q8WXD2 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SCG3Q8WXD2 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCG3Q8WXD2 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCG3Q8WXD2 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCG3Q8WXD2 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SCG3Q8WXD2 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCG3Q8WXD2 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCG3Q8WXD2 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCG3Q8WXD2 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCG3Q8WXD2 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCG3Q8WXD2 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCG3Q8WXD2 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCG3Q8WXD2 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCG3Q8WXD2 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCG3Q8WXD2 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCG3Q8WXD2 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCG3Q8WXD2 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SCG3Q8WXD2 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCG3Q8WXD2 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCG3Q8WXD2 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCG3Q8WXD2 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCG3Q8WXD2 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCG3Q8WXD2 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCG3Q8WXD2 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCG3Q8WXD2 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCG3Q8WXD2 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCG3Q8WXD2 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SCG3Q8WXD2 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCG3Q8WXD2 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCG3Q8WXD2 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCG3Q8WXD2 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCG3Q8WXD2 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCG3Q8WXD2 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCG3Q8WXD2 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCG3Q8WXD2 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCG3Q8WXD2 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCG3Q8WXD2 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCG3Q8WXD2 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCG3Q8WXD2 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCG3Q8WXD2 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCG3Q8WXD2 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCG3Q8WXD2 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCG3Q8WXD2 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCG3Q8WXD2 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCG3Q8WXD2 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCG3Q8WXD2 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCG3Q8WXD2 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCG3Q8WXD2 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCG3Q8WXD2 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCG3Q8WXD2 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCG3Q8WXD2 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCG3Q8WXD2 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCG3Q8WXD2 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCG3Q8WXD2 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCG3Q8WXD2 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCG3Q8WXD2 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCG3Q8WXD2 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCG3Q8WXD2 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms