Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUR7

C15orf40, UPF0235 protein C15orf40, humanhuman

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Length 153 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf40Q8WUR7 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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C15orf40Q8WUR7 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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C15orf40Q8WUR7 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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C15orf40Q8WUR7 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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C15orf40Q8WUR7 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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C15orf40Q8WUR7 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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C15orf40Q8WUR7 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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C15orf40Q8WUR7 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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C15orf40Q8WUR7 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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C15orf40Q8WUR7 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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C15orf40Q8WUR7 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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