Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTU0

DDI1, Protein DDI1 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDI1Q8WTU0 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DDI1Q8WTU0 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DDI1Q8WTU0 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DDI1Q8WTU0 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DDI1Q8WTU0 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DDI1Q8WTU0 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DDI1Q8WTU0 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DDI1Q8WTU0 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DDI1Q8WTU0 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DDI1Q8WTU0 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DDI1Q8WTU0 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DDI1Q8WTU0 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DDI1Q8WTU0 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DDI1Q8WTU0 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DDI1Q8WTU0 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DDI1Q8WTU0 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DDI1Q8WTU0 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DDI1Q8WTU0 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DDI1Q8WTU0 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DDI1Q8WTU0 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DDI1Q8WTU0 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DDI1Q8WTU0 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DDI1Q8WTU0 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DDI1Q8WTU0 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DDI1Q8WTU0 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DDI1Q8WTU0 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
DDI1Q8WTU0 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
DDI1Q8WTU0 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DDI1Q8WTU0 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DDI1Q8WTU0 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DDI1Q8WTU0 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DDI1Q8WTU0 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DDI1Q8WTU0 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DDI1Q8WTU0 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DDI1Q8WTU0 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DDI1Q8WTU0 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DDI1Q8WTU0 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DDI1Q8WTU0 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DDI1Q8WTU0 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DDI1Q8WTU0 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DDI1Q8WTU0 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DDI1Q8WTU0 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DDI1Q8WTU0 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DDI1Q8WTU0 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DDI1Q8WTU0 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DDI1Q8WTU0 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DDI1Q8WTU0 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DDI1Q8WTU0 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DDI1Q8WTU0 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DDI1Q8WTU0 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
DDI1Q8WTU0 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DDI1Q8WTU0 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DDI1Q8WTU0 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DDI1Q8WTU0 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DDI1Q8WTU0 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DDI1Q8WTU0 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DDI1Q8WTU0 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DDI1Q8WTU0 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DDI1Q8WTU0 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DDI1Q8WTU0 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DDI1Q8WTU0 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DDI1Q8WTU0 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DDI1Q8WTU0 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DDI1Q8WTU0 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DDI1Q8WTU0 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DDI1Q8WTU0 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DDI1Q8WTU0 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
DDI1Q8WTU0 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
DDI1Q8WTU0 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DDI1Q8WTU0 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
DDI1Q8WTU0 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DDI1Q8WTU0 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DDI1Q8WTU0 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
DDI1Q8WTU0 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DDI1Q8WTU0 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DDI1Q8WTU0 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DDI1Q8WTU0 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DDI1Q8WTU0 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DDI1Q8WTU0 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
DDI1Q8WTU0 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DDI1Q8WTU0 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DDI1Q8WTU0 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DDI1Q8WTU0 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DDI1Q8WTU0 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DDI1Q8WTU0 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DDI1Q8WTU0 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DDI1Q8WTU0 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DDI1Q8WTU0 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DDI1Q8WTU0 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DDI1Q8WTU0 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DDI1Q8WTU0 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DDI1Q8WTU0 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DDI1Q8WTU0 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DDI1Q8WTU0 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DDI1Q8WTU0 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
DDI1Q8WTU0 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DDI1Q8WTU0 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DDI1Q8WTU0 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DDI1Q8WTU0 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DDI1Q8WTU0 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms