Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDC3

BRSK1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK1Q8TDC3 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms