Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATL2Q8NHH9 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATL2Q8NHH9 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATL2Q8NHH9 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATL2Q8NHH9 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATL2Q8NHH9 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATL2Q8NHH9 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATL2Q8NHH9 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATL2Q8NHH9 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATL2Q8NHH9 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATL2Q8NHH9 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ATL2Q8NHH9 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
ATL2Q8NHH9 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ATL2Q8NHH9 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
ATL2Q8NHH9 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATL2Q8NHH9 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATL2Q8NHH9 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
ATL2Q8NHH9 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATL2Q8NHH9 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATL2Q8NHH9 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATL2Q8NHH9 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATL2Q8NHH9 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATL2Q8NHH9 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATL2Q8NHH9 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATL2Q8NHH9 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATL2Q8NHH9 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
ATL2Q8NHH9 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATL2Q8NHH9 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATL2Q8NHH9 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATL2Q8NHH9 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATL2Q8NHH9 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATL2Q8NHH9 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATL2Q8NHH9 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATL2Q8NHH9 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATL2Q8NHH9 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATL2Q8NHH9 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATL2Q8NHH9 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATL2Q8NHH9 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATL2Q8NHH9 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATL2Q8NHH9 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATL2Q8NHH9 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATL2Q8NHH9 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATL2Q8NHH9 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATL2Q8NHH9 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATL2Q8NHH9 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATL2Q8NHH9 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATL2Q8NHH9 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATL2Q8NHH9 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATL2Q8NHH9 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATL2Q8NHH9 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATL2Q8NHH9 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATL2Q8NHH9 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATL2Q8NHH9 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATL2Q8NHH9 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATL2Q8NHH9 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATL2Q8NHH9 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ATL2Q8NHH9 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATL2Q8NHH9 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATL2Q8NHH9 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATL2Q8NHH9 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATL2Q8NHH9 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATL2Q8NHH9 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATL2Q8NHH9 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATL2Q8NHH9 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATL2Q8NHH9 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATL2Q8NHH9 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATL2Q8NHH9 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATL2Q8NHH9 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATL2Q8NHH9 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATL2Q8NHH9 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATL2Q8NHH9 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATL2Q8NHH9 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATL2Q8NHH9 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATL2Q8NHH9 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATL2Q8NHH9 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATL2Q8NHH9 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATL2Q8NHH9 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATL2Q8NHH9 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATL2Q8NHH9 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATL2Q8NHH9 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATL2Q8NHH9 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATL2Q8NHH9 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATL2Q8NHH9 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATL2Q8NHH9 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATL2Q8NHH9 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATL2Q8NHH9 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATL2Q8NHH9 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATL2Q8NHH9 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATL2Q8NHH9 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATL2Q8NHH9 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATL2Q8NHH9 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATL2Q8NHH9 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATL2Q8NHH9 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ATL2Q8NHH9 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATL2Q8NHH9 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATL2Q8NHH9 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATL2Q8NHH9 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATL2Q8NHH9 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATL2Q8NHH9 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ATL2Q8NHH9 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms