Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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