Protein–RNA interactions for Protein: Q8N144

GJD3, Gap junction delta-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD3Q8N144 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJD3Q8N144 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJD3Q8N144 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJD3Q8N144 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJD3Q8N144 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJD3Q8N144 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJD3Q8N144 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJD3Q8N144 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJD3Q8N144 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJD3Q8N144 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GJD3Q8N144 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GJD3Q8N144 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJD3Q8N144 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GJD3Q8N144 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJD3Q8N144 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GJD3Q8N144 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJD3Q8N144 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJD3Q8N144 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJD3Q8N144 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJD3Q8N144 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJD3Q8N144 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJD3Q8N144 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GJD3Q8N144 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJD3Q8N144 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJD3Q8N144 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJD3Q8N144 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJD3Q8N144 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJD3Q8N144 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GJD3Q8N144 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJD3Q8N144 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJD3Q8N144 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJD3Q8N144 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJD3Q8N144 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJD3Q8N144 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJD3Q8N144 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJD3Q8N144 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GJD3Q8N144 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJD3Q8N144 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJD3Q8N144 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJD3Q8N144 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GJD3Q8N144 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GJD3Q8N144 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJD3Q8N144 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJD3Q8N144 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJD3Q8N144 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJD3Q8N144 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GJD3Q8N144 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GJD3Q8N144 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJD3Q8N144 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJD3Q8N144 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJD3Q8N144 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GJD3Q8N144 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJD3Q8N144 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJD3Q8N144 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJD3Q8N144 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJD3Q8N144 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJD3Q8N144 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJD3Q8N144 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJD3Q8N144 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJD3Q8N144 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJD3Q8N144 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJD3Q8N144 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJD3Q8N144 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJD3Q8N144 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJD3Q8N144 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJD3Q8N144 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJD3Q8N144 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJD3Q8N144 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJD3Q8N144 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJD3Q8N144 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJD3Q8N144 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJD3Q8N144 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJD3Q8N144 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJD3Q8N144 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJD3Q8N144 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJD3Q8N144 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJD3Q8N144 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJD3Q8N144 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJD3Q8N144 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJD3Q8N144 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJD3Q8N144 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJD3Q8N144 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GJD3Q8N144 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJD3Q8N144 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJD3Q8N144 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJD3Q8N144 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJD3Q8N144 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJD3Q8N144 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJD3Q8N144 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJD3Q8N144 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GJD3Q8N144 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GJD3Q8N144 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJD3Q8N144 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJD3Q8N144 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJD3Q8N144 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJD3Q8N144 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJD3Q8N144 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJD3Q8N144 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJD3Q8N144 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJD3Q8N144 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms