Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV65

FAM47E, Protein FAM47E, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47EQ6ZV65 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
FAM47EQ6ZV65 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
FAM47EQ6ZV65 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
FAM47EQ6ZV65 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
FAM47EQ6ZV65 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM47EQ6ZV65 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM47EQ6ZV65 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM47EQ6ZV65 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM47EQ6ZV65 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM47EQ6ZV65 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM47EQ6ZV65 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM47EQ6ZV65 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM47EQ6ZV65 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM47EQ6ZV65 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM47EQ6ZV65 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM47EQ6ZV65 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM47EQ6ZV65 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM47EQ6ZV65 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM47EQ6ZV65 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM47EQ6ZV65 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM47EQ6ZV65 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM47EQ6ZV65 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM47EQ6ZV65 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM47EQ6ZV65 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM47EQ6ZV65 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM47EQ6ZV65 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM47EQ6ZV65 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM47EQ6ZV65 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM47EQ6ZV65 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM47EQ6ZV65 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM47EQ6ZV65 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM47EQ6ZV65 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM47EQ6ZV65 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM47EQ6ZV65 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM47EQ6ZV65 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM47EQ6ZV65 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms