Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms