Protein–RNA interactions for Protein: Q6U841

SLC4A10, Sodium-driven chloride bicarbonate exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A10Q6U841 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC4A10Q6U841 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC4A10Q6U841 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC4A10Q6U841 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC4A10Q6U841 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC4A10Q6U841 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC4A10Q6U841 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC4A10Q6U841 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC4A10Q6U841 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC4A10Q6U841 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC4A10Q6U841 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC4A10Q6U841 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC4A10Q6U841 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC4A10Q6U841 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC4A10Q6U841 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC4A10Q6U841 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC4A10Q6U841 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC4A10Q6U841 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC4A10Q6U841 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC4A10Q6U841 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC4A10Q6U841 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC4A10Q6U841 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC4A10Q6U841 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC4A10Q6U841 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC4A10Q6U841 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC4A10Q6U841 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC4A10Q6U841 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC4A10Q6U841 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC4A10Q6U841 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC4A10Q6U841 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC4A10Q6U841 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC4A10Q6U841 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC4A10Q6U841 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC4A10Q6U841 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC4A10Q6U841 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC4A10Q6U841 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC4A10Q6U841 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC4A10Q6U841 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC4A10Q6U841 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC4A10Q6U841 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC4A10Q6U841 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC4A10Q6U841 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC4A10Q6U841 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC4A10Q6U841 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC4A10Q6U841 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC4A10Q6U841 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC4A10Q6U841 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC4A10Q6U841 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC4A10Q6U841 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC4A10Q6U841 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC4A10Q6U841 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC4A10Q6U841 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC4A10Q6U841 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC4A10Q6U841 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC4A10Q6U841 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC4A10Q6U841 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC4A10Q6U841 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC4A10Q6U841 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC4A10Q6U841 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC4A10Q6U841 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC4A10Q6U841 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC4A10Q6U841 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC4A10Q6U841 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC4A10Q6U841 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC4A10Q6U841 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC4A10Q6U841 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC4A10Q6U841 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC4A10Q6U841 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC4A10Q6U841 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC4A10Q6U841 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC4A10Q6U841 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC4A10Q6U841 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC4A10Q6U841 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC4A10Q6U841 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC4A10Q6U841 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC4A10Q6U841 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC4A10Q6U841 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC4A10Q6U841 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC4A10Q6U841 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC4A10Q6U841 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC4A10Q6U841 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC4A10Q6U841 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC4A10Q6U841 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC4A10Q6U841 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC4A10Q6U841 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC4A10Q6U841 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC4A10Q6U841 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC4A10Q6U841 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC4A10Q6U841 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC4A10Q6U841 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC4A10Q6U841 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC4A10Q6U841 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC4A10Q6U841 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC4A10Q6U841 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC4A10Q6U841 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC4A10Q6U841 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC4A10Q6U841 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC4A10Q6U841 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC4A10Q6U841 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC4A10Q6U841 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms