Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms