Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms