Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms