Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
STRIP1Q5VSL9 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
STRIP1Q5VSL9 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
STRIP1Q5VSL9 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
STRIP1Q5VSL9 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
STRIP1Q5VSL9 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
STRIP1Q5VSL9 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
STRIP1Q5VSL9 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
STRIP1Q5VSL9 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
STRIP1Q5VSL9 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
STRIP1Q5VSL9 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
STRIP1Q5VSL9 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
STRIP1Q5VSL9 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
STRIP1Q5VSL9 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
STRIP1Q5VSL9 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
STRIP1Q5VSL9 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
STRIP1Q5VSL9 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
STRIP1Q5VSL9 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
STRIP1Q5VSL9 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
STRIP1Q5VSL9 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
STRIP1Q5VSL9 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
STRIP1Q5VSL9 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
STRIP1Q5VSL9 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
STRIP1Q5VSL9 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
STRIP1Q5VSL9 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
STRIP1Q5VSL9 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
STRIP1Q5VSL9 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
STRIP1Q5VSL9 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
STRIP1Q5VSL9 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
STRIP1Q5VSL9 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
STRIP1Q5VSL9 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
STRIP1Q5VSL9 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
STRIP1Q5VSL9 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
STRIP1Q5VSL9 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
STRIP1Q5VSL9 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
STRIP1Q5VSL9 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
STRIP1Q5VSL9 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
STRIP1Q5VSL9 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
STRIP1Q5VSL9 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
STRIP1Q5VSL9 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
STRIP1Q5VSL9 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
STRIP1Q5VSL9 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
STRIP1Q5VSL9 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
STRIP1Q5VSL9 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
STRIP1Q5VSL9 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
STRIP1Q5VSL9 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
STRIP1Q5VSL9 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
STRIP1Q5VSL9 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
STRIP1Q5VSL9 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
STRIP1Q5VSL9 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
STRIP1Q5VSL9 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
STRIP1Q5VSL9 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
STRIP1Q5VSL9 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
STRIP1Q5VSL9 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
STRIP1Q5VSL9 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
STRIP1Q5VSL9 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
STRIP1Q5VSL9 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
STRIP1Q5VSL9 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
STRIP1Q5VSL9 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
STRIP1Q5VSL9 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
STRIP1Q5VSL9 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
STRIP1Q5VSL9 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
STRIP1Q5VSL9 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
STRIP1Q5VSL9 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
STRIP1Q5VSL9 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
STRIP1Q5VSL9 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
STRIP1Q5VSL9 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
STRIP1Q5VSL9 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
STRIP1Q5VSL9 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
STRIP1Q5VSL9 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
STRIP1Q5VSL9 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
STRIP1Q5VSL9 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
STRIP1Q5VSL9 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
STRIP1Q5VSL9 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
STRIP1Q5VSL9 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
STRIP1Q5VSL9 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
STRIP1Q5VSL9 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
STRIP1Q5VSL9 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
STRIP1Q5VSL9 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
STRIP1Q5VSL9 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
STRIP1Q5VSL9 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
STRIP1Q5VSL9 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
STRIP1Q5VSL9 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
STRIP1Q5VSL9 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
STRIP1Q5VSL9 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
STRIP1Q5VSL9 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
STRIP1Q5VSL9 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
STRIP1Q5VSL9 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
STRIP1Q5VSL9 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
STRIP1Q5VSL9 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
STRIP1Q5VSL9 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
STRIP1Q5VSL9 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
STRIP1Q5VSL9 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
STRIP1Q5VSL9 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
STRIP1Q5VSL9 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
STRIP1Q5VSL9 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
STRIP1Q5VSL9 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
STRIP1Q5VSL9 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
STRIP1Q5VSL9 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
STRIP1Q5VSL9 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms