Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2R2

PDSS1, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS1Q5T2R2 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDSS1Q5T2R2 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDSS1Q5T2R2 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDSS1Q5T2R2 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDSS1Q5T2R2 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDSS1Q5T2R2 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDSS1Q5T2R2 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDSS1Q5T2R2 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDSS1Q5T2R2 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDSS1Q5T2R2 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDSS1Q5T2R2 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDSS1Q5T2R2 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDSS1Q5T2R2 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDSS1Q5T2R2 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDSS1Q5T2R2 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDSS1Q5T2R2 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDSS1Q5T2R2 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDSS1Q5T2R2 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDSS1Q5T2R2 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PDSS1Q5T2R2 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PDSS1Q5T2R2 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDSS1Q5T2R2 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDSS1Q5T2R2 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDSS1Q5T2R2 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDSS1Q5T2R2 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDSS1Q5T2R2 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDSS1Q5T2R2 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDSS1Q5T2R2 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDSS1Q5T2R2 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDSS1Q5T2R2 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDSS1Q5T2R2 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDSS1Q5T2R2 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDSS1Q5T2R2 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDSS1Q5T2R2 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDSS1Q5T2R2 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDSS1Q5T2R2 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDSS1Q5T2R2 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDSS1Q5T2R2 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDSS1Q5T2R2 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDSS1Q5T2R2 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDSS1Q5T2R2 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDSS1Q5T2R2 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDSS1Q5T2R2 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDSS1Q5T2R2 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDSS1Q5T2R2 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDSS1Q5T2R2 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDSS1Q5T2R2 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDSS1Q5T2R2 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PDSS1Q5T2R2 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDSS1Q5T2R2 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDSS1Q5T2R2 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PDSS1Q5T2R2 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDSS1Q5T2R2 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDSS1Q5T2R2 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDSS1Q5T2R2 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDSS1Q5T2R2 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDSS1Q5T2R2 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDSS1Q5T2R2 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDSS1Q5T2R2 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDSS1Q5T2R2 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDSS1Q5T2R2 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDSS1Q5T2R2 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDSS1Q5T2R2 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDSS1Q5T2R2 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDSS1Q5T2R2 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDSS1Q5T2R2 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDSS1Q5T2R2 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDSS1Q5T2R2 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDSS1Q5T2R2 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDSS1Q5T2R2 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDSS1Q5T2R2 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDSS1Q5T2R2 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDSS1Q5T2R2 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDSS1Q5T2R2 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDSS1Q5T2R2 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDSS1Q5T2R2 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDSS1Q5T2R2 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDSS1Q5T2R2 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDSS1Q5T2R2 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDSS1Q5T2R2 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDSS1Q5T2R2 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDSS1Q5T2R2 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDSS1Q5T2R2 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDSS1Q5T2R2 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDSS1Q5T2R2 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDSS1Q5T2R2 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PDSS1Q5T2R2 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDSS1Q5T2R2 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDSS1Q5T2R2 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDSS1Q5T2R2 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDSS1Q5T2R2 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDSS1Q5T2R2 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDSS1Q5T2R2 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDSS1Q5T2R2 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDSS1Q5T2R2 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDSS1Q5T2R2 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDSS1Q5T2R2 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDSS1Q5T2R2 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDSS1Q5T2R2 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDSS1Q5T2R2 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms