Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms