Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQH8

C6orf136, Uncharacterized protein C6orf136, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf136Q5SQH8 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C6orf136Q5SQH8 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C6orf136Q5SQH8 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C6orf136Q5SQH8 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C6orf136Q5SQH8 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C6orf136Q5SQH8 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C6orf136Q5SQH8 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C6orf136Q5SQH8 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C6orf136Q5SQH8 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
C6orf136Q5SQH8 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C6orf136Q5SQH8 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C6orf136Q5SQH8 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C6orf136Q5SQH8 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C6orf136Q5SQH8 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C6orf136Q5SQH8 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C6orf136Q5SQH8 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C6orf136Q5SQH8 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C6orf136Q5SQH8 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C6orf136Q5SQH8 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C6orf136Q5SQH8 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C6orf136Q5SQH8 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C6orf136Q5SQH8 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C6orf136Q5SQH8 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C6orf136Q5SQH8 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C6orf136Q5SQH8 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C6orf136Q5SQH8 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C6orf136Q5SQH8 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C6orf136Q5SQH8 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C6orf136Q5SQH8 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
C6orf136Q5SQH8 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
C6orf136Q5SQH8 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C6orf136Q5SQH8 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C6orf136Q5SQH8 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C6orf136Q5SQH8 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C6orf136Q5SQH8 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C6orf136Q5SQH8 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C6orf136Q5SQH8 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C6orf136Q5SQH8 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C6orf136Q5SQH8 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C6orf136Q5SQH8 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
C6orf136Q5SQH8 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C6orf136Q5SQH8 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C6orf136Q5SQH8 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C6orf136Q5SQH8 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C6orf136Q5SQH8 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C6orf136Q5SQH8 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C6orf136Q5SQH8 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
C6orf136Q5SQH8 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C6orf136Q5SQH8 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C6orf136Q5SQH8 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C6orf136Q5SQH8 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C6orf136Q5SQH8 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C6orf136Q5SQH8 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
C6orf136Q5SQH8 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C6orf136Q5SQH8 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
C6orf136Q5SQH8 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
C6orf136Q5SQH8 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
C6orf136Q5SQH8 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C6orf136Q5SQH8 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C6orf136Q5SQH8 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C6orf136Q5SQH8 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C6orf136Q5SQH8 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C6orf136Q5SQH8 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C6orf136Q5SQH8 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C6orf136Q5SQH8 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C6orf136Q5SQH8 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C6orf136Q5SQH8 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C6orf136Q5SQH8 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C6orf136Q5SQH8 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C6orf136Q5SQH8 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C6orf136Q5SQH8 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C6orf136Q5SQH8 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C6orf136Q5SQH8 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C6orf136Q5SQH8 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C6orf136Q5SQH8 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C6orf136Q5SQH8 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C6orf136Q5SQH8 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C6orf136Q5SQH8 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
C6orf136Q5SQH8 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C6orf136Q5SQH8 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C6orf136Q5SQH8 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C6orf136Q5SQH8 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C6orf136Q5SQH8 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C6orf136Q5SQH8 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C6orf136Q5SQH8 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C6orf136Q5SQH8 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C6orf136Q5SQH8 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C6orf136Q5SQH8 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C6orf136Q5SQH8 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C6orf136Q5SQH8 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C6orf136Q5SQH8 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C6orf136Q5SQH8 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C6orf136Q5SQH8 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C6orf136Q5SQH8 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C6orf136Q5SQH8 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C6orf136Q5SQH8 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C6orf136Q5SQH8 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C6orf136Q5SQH8 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C6orf136Q5SQH8 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C6orf136Q5SQH8 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms