Protein–RNA interactions for Protein: Q5M9N0

CCDC158, Coiled-coil domain-containing protein 158, humanhuman

Predictions only

Length 1,113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC158Q5M9N0 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms