Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms