Protein–RNA interactions for Protein: Q53GG5

PDLIM3, PDZ and LIM domain protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM3Q53GG5 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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PDLIM3Q53GG5 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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