Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms