Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GREB1Q4ZG55 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GREB1Q4ZG55 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GREB1Q4ZG55 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GREB1Q4ZG55 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GREB1Q4ZG55 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GREB1Q4ZG55 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GREB1Q4ZG55 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GREB1Q4ZG55 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GREB1Q4ZG55 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GREB1Q4ZG55 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GREB1Q4ZG55 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GREB1Q4ZG55 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GREB1Q4ZG55 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GREB1Q4ZG55 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GREB1Q4ZG55 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GREB1Q4ZG55 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GREB1Q4ZG55 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GREB1Q4ZG55 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GREB1Q4ZG55 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GREB1Q4ZG55 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GREB1Q4ZG55 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GREB1Q4ZG55 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GREB1Q4ZG55 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GREB1Q4ZG55 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GREB1Q4ZG55 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GREB1Q4ZG55 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GREB1Q4ZG55 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GREB1Q4ZG55 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GREB1Q4ZG55 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GREB1Q4ZG55 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GREB1Q4ZG55 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GREB1Q4ZG55 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GREB1Q4ZG55 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GREB1Q4ZG55 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GREB1Q4ZG55 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GREB1Q4ZG55 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GREB1Q4ZG55 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GREB1Q4ZG55 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GREB1Q4ZG55 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GREB1Q4ZG55 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GREB1Q4ZG55 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GREB1Q4ZG55 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GREB1Q4ZG55 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GREB1Q4ZG55 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GREB1Q4ZG55 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GREB1Q4ZG55 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GREB1Q4ZG55 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GREB1Q4ZG55 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GREB1Q4ZG55 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GREB1Q4ZG55 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GREB1Q4ZG55 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GREB1Q4ZG55 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GREB1Q4ZG55 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GREB1Q4ZG55 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GREB1Q4ZG55 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GREB1Q4ZG55 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GREB1Q4ZG55 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GREB1Q4ZG55 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GREB1Q4ZG55 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GREB1Q4ZG55 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GREB1Q4ZG55 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GREB1Q4ZG55 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GREB1Q4ZG55 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GREB1Q4ZG55 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GREB1Q4ZG55 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GREB1Q4ZG55 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GREB1Q4ZG55 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GREB1Q4ZG55 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GREB1Q4ZG55 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GREB1Q4ZG55 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GREB1Q4ZG55 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GREB1Q4ZG55 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GREB1Q4ZG55 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GREB1Q4ZG55 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GREB1Q4ZG55 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GREB1Q4ZG55 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GREB1Q4ZG55 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GREB1Q4ZG55 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GREB1Q4ZG55 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GREB1Q4ZG55 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GREB1Q4ZG55 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GREB1Q4ZG55 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GREB1Q4ZG55 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GREB1Q4ZG55 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GREB1Q4ZG55 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GREB1Q4ZG55 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GREB1Q4ZG55 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GREB1Q4ZG55 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GREB1Q4ZG55 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GREB1Q4ZG55 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GREB1Q4ZG55 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GREB1Q4ZG55 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GREB1Q4ZG55 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GREB1Q4ZG55 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GREB1Q4ZG55 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GREB1Q4ZG55 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GREB1Q4ZG55 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GREB1Q4ZG55 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GREB1Q4ZG55 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms