Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms