Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms