Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FAM187BQ17R55 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
FAM187BQ17R55 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FAM187BQ17R55 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FAM187BQ17R55 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FAM187BQ17R55 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
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FAM187BQ17R55 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
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FAM187BQ17R55 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
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FAM187BQ17R55 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM187BQ17R55 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM187BQ17R55 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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FAM187BQ17R55 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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FAM187BQ17R55 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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FAM187BQ17R55 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM187BQ17R55 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM187BQ17R55 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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FAM187BQ17R55 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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FAM187BQ17R55 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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FAM187BQ17R55 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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FAM187BQ17R55 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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FAM187BQ17R55 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM187BQ17R55 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM187BQ17R55 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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FAM187BQ17R55 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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FAM187BQ17R55 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM187BQ17R55 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM187BQ17R55 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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FAM187BQ17R55 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM187BQ17R55 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM187BQ17R55 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM187BQ17R55 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM187BQ17R55 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM187BQ17R55 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM187BQ17R55 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM187BQ17R55 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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FAM187BQ17R55 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM187BQ17R55 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM187BQ17R55 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM187BQ17R55 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM187BQ17R55 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM187BQ17R55 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM187BQ17R55 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
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