Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
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