Protein–RNA interactions for Protein: Q16828

DUSP6, Dual specificity protein phosphatase 6, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP6Q16828 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DUSP6Q16828 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
DUSP6Q16828 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DUSP6Q16828 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DUSP6Q16828 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DUSP6Q16828 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DUSP6Q16828 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DUSP6Q16828 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DUSP6Q16828 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DUSP6Q16828 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DUSP6Q16828 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DUSP6Q16828 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DUSP6Q16828 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DUSP6Q16828 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUSP6Q16828 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUSP6Q16828 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUSP6Q16828 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUSP6Q16828 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUSP6Q16828 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUSP6Q16828 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUSP6Q16828 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUSP6Q16828 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUSP6Q16828 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUSP6Q16828 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUSP6Q16828 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUSP6Q16828 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUSP6Q16828 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
DUSP6Q16828 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUSP6Q16828 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUSP6Q16828 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUSP6Q16828 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUSP6Q16828 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUSP6Q16828 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUSP6Q16828 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUSP6Q16828 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUSP6Q16828 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUSP6Q16828 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUSP6Q16828 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUSP6Q16828 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUSP6Q16828 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUSP6Q16828 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUSP6Q16828 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUSP6Q16828 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
DUSP6Q16828 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUSP6Q16828 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
DUSP6Q16828 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUSP6Q16828 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUSP6Q16828 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUSP6Q16828 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUSP6Q16828 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUSP6Q16828 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUSP6Q16828 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUSP6Q16828 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
DUSP6Q16828 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
DUSP6Q16828 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUSP6Q16828 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUSP6Q16828 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUSP6Q16828 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUSP6Q16828 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUSP6Q16828 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUSP6Q16828 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUSP6Q16828 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUSP6Q16828 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUSP6Q16828 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUSP6Q16828 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUSP6Q16828 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUSP6Q16828 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUSP6Q16828 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUSP6Q16828 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUSP6Q16828 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUSP6Q16828 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUSP6Q16828 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP6Q16828 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP6Q16828 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP6Q16828 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP6Q16828 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP6Q16828 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP6Q16828 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP6Q16828 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP6Q16828 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP6Q16828 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP6Q16828 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP6Q16828 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP6Q16828 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP6Q16828 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP6Q16828 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP6Q16828 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP6Q16828 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP6Q16828 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP6Q16828 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP6Q16828 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP6Q16828 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP6Q16828 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP6Q16828 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP6Q16828 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms