Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms