Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
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