Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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