Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
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CNGA3Q16281 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
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CNGA3Q16281 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
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CNGA3Q16281 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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CNGA3Q16281 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
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CNGA3Q16281 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
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CNGA3Q16281 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
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CNGA3Q16281 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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CNGA3Q16281 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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CNGA3Q16281 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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