Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

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Length 529 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRNA2Q15822 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
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