Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SF1Q15637 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SF1Q15637 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SF1Q15637 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SF1Q15637 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SF1Q15637 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SF1Q15637 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SF1Q15637 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SF1Q15637 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SF1Q15637 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SF1Q15637 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SF1Q15637 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SF1Q15637 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SF1Q15637 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SF1Q15637 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SF1Q15637 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SF1Q15637 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SF1Q15637 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SF1Q15637 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SF1Q15637 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SF1Q15637 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SF1Q15637 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SF1Q15637 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SF1Q15637 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SF1Q15637 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SF1Q15637 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SF1Q15637 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SF1Q15637 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SF1Q15637 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SF1Q15637 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SF1Q15637 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SF1Q15637 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SF1Q15637 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SF1Q15637 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SF1Q15637 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SF1Q15637 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SF1Q15637 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SF1Q15637 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SF1Q15637 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SF1Q15637 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SF1Q15637 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SF1Q15637 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SF1Q15637 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SF1Q15637 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SF1Q15637 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SF1Q15637 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SF1Q15637 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SF1Q15637 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SF1Q15637 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SF1Q15637 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SF1Q15637 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SF1Q15637 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SF1Q15637 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SF1Q15637 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SF1Q15637 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SF1Q15637 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SF1Q15637 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SF1Q15637 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SF1Q15637 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SF1Q15637 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SF1Q15637 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SF1Q15637 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SF1Q15637 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SF1Q15637 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SF1Q15637 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SF1Q15637 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SF1Q15637 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SF1Q15637 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SF1Q15637 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SF1Q15637 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SF1Q15637 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SF1Q15637 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SF1Q15637 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SF1Q15637 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SF1Q15637 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SF1Q15637 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SF1Q15637 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SF1Q15637 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SF1Q15637 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SF1Q15637 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SF1Q15637 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SF1Q15637 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SF1Q15637 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SF1Q15637 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SF1Q15637 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SF1Q15637 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SF1Q15637 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SF1Q15637 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SF1Q15637 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SF1Q15637 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SF1Q15637 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SF1Q15637 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SF1Q15637 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SF1Q15637 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SF1Q15637 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SF1Q15637 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SF1Q15637 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SF1Q15637 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SF1Q15637 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SF1Q15637 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
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