Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TCEA2Q15560 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TCEA2Q15560 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TCEA2Q15560 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TCEA2Q15560 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TCEA2Q15560 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TCEA2Q15560 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TCEA2Q15560 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TCEA2Q15560 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TCEA2Q15560 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TCEA2Q15560 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TCEA2Q15560 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TCEA2Q15560 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TCEA2Q15560 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TCEA2Q15560 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TCEA2Q15560 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TCEA2Q15560 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TCEA2Q15560 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TCEA2Q15560 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TCEA2Q15560 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TCEA2Q15560 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TCEA2Q15560 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TCEA2Q15560 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TCEA2Q15560 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TCEA2Q15560 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TCEA2Q15560 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TCEA2Q15560 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TCEA2Q15560 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TCEA2Q15560 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TCEA2Q15560 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TCEA2Q15560 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TCEA2Q15560 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TCEA2Q15560 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TCEA2Q15560 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TCEA2Q15560 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TCEA2Q15560 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TCEA2Q15560 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TCEA2Q15560 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TCEA2Q15560 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TCEA2Q15560 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TCEA2Q15560 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TCEA2Q15560 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TCEA2Q15560 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TCEA2Q15560 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TCEA2Q15560 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TCEA2Q15560 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TCEA2Q15560 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TCEA2Q15560 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TCEA2Q15560 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TCEA2Q15560 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TCEA2Q15560 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TCEA2Q15560 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TCEA2Q15560 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TCEA2Q15560 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TCEA2Q15560 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TCEA2Q15560 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TCEA2Q15560 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TCEA2Q15560 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TCEA2Q15560 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TCEA2Q15560 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TCEA2Q15560 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TCEA2Q15560 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TCEA2Q15560 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TCEA2Q15560 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TCEA2Q15560 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TCEA2Q15560 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TCEA2Q15560 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TCEA2Q15560 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TCEA2Q15560 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TCEA2Q15560 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TCEA2Q15560 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TCEA2Q15560 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TCEA2Q15560 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TCEA2Q15560 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TCEA2Q15560 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TCEA2Q15560 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TCEA2Q15560 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TCEA2Q15560 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TCEA2Q15560 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TCEA2Q15560 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TCEA2Q15560 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TCEA2Q15560 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TCEA2Q15560 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TCEA2Q15560 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TCEA2Q15560 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TCEA2Q15560 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TCEA2Q15560 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TCEA2Q15560 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TCEA2Q15560 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TCEA2Q15560 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TCEA2Q15560 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TCEA2Q15560 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TCEA2Q15560 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TCEA2Q15560 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TCEA2Q15560 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TCEA2Q15560 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TCEA2Q15560 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TCEA2Q15560 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TCEA2Q15560 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TCEA2Q15560 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms