Protein–RNA interactions for Protein: Q15459

SF3A1, Splicing factor 3A subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A1Q15459 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
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SF3A1Q15459 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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SF3A1Q15459 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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SF3A1Q15459 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
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