Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

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Length 398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
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CYTH1Q15438 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
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CYTH1Q15438 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
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CYTH1Q15438 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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CYTH1Q15438 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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CYTH1Q15438 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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CYTH1Q15438 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
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CYTH1Q15438 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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