Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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