Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SHPRHQ149N8 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SHPRHQ149N8 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SHPRHQ149N8 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SHPRHQ149N8 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SHPRHQ149N8 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SHPRHQ149N8 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SHPRHQ149N8 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SHPRHQ149N8 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SHPRHQ149N8 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SHPRHQ149N8 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SHPRHQ149N8 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SHPRHQ149N8 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SHPRHQ149N8 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SHPRHQ149N8 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SHPRHQ149N8 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SHPRHQ149N8 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SHPRHQ149N8 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SHPRHQ149N8 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SHPRHQ149N8 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SHPRHQ149N8 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SHPRHQ149N8 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SHPRHQ149N8 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
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