Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GBX1Q14549 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GBX1Q14549 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GBX1Q14549 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GBX1Q14549 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GBX1Q14549 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GBX1Q14549 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GBX1Q14549 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GBX1Q14549 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GBX1Q14549 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GBX1Q14549 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GBX1Q14549 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GBX1Q14549 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GBX1Q14549 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GBX1Q14549 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GBX1Q14549 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GBX1Q14549 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GBX1Q14549 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GBX1Q14549 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GBX1Q14549 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GBX1Q14549 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GBX1Q14549 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GBX1Q14549 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GBX1Q14549 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GBX1Q14549 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GBX1Q14549 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GBX1Q14549 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GBX1Q14549 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GBX1Q14549 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GBX1Q14549 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GBX1Q14549 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GBX1Q14549 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GBX1Q14549 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GBX1Q14549 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GBX1Q14549 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GBX1Q14549 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GBX1Q14549 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GBX1Q14549 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GBX1Q14549 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GBX1Q14549 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GBX1Q14549 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GBX1Q14549 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GBX1Q14549 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GBX1Q14549 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GBX1Q14549 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GBX1Q14549 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GBX1Q14549 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GBX1Q14549 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GBX1Q14549 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GBX1Q14549 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GBX1Q14549 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GBX1Q14549 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GBX1Q14549 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GBX1Q14549 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GBX1Q14549 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GBX1Q14549 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GBX1Q14549 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GBX1Q14549 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GBX1Q14549 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GBX1Q14549 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GBX1Q14549 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GBX1Q14549 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GBX1Q14549 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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GBX1Q14549 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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