Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms