Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
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