Protein–RNA interactions for Protein: Q13557

CAMK2D, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2DQ13557 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAMK2DQ13557 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CAMK2DQ13557 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAMK2DQ13557 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CAMK2DQ13557 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CAMK2DQ13557 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAMK2DQ13557 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAMK2DQ13557 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAMK2DQ13557 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAMK2DQ13557 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAMK2DQ13557 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAMK2DQ13557 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAMK2DQ13557 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAMK2DQ13557 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAMK2DQ13557 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAMK2DQ13557 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAMK2DQ13557 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAMK2DQ13557 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAMK2DQ13557 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAMK2DQ13557 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAMK2DQ13557 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAMK2DQ13557 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAMK2DQ13557 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAMK2DQ13557 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CAMK2DQ13557 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CAMK2DQ13557 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CAMK2DQ13557 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CAMK2DQ13557 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms