Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
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