Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Length 168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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